上海临床研究中心临床系统生物学平台，是依托新型研究型医院构架、由我国蛋白质组学和系统生物学开拓者之一的曾嵘教授携团队全力打造的创新研究平台。平台致力于推动前沿科学技术与临床研究需求紧密对接，基于大规模人群分子网络定量数据，开发个性化动态分子网络智能分析系统，为开展临床研究和高质量医疗服务提供系统支持。相关研究进展已在Nature Medicine、Cancer Cell、Cell Metabolism、Cell Genomics等期刊发表。
通过与国家蛋白质科学研究（上海）设施成立联合实验室，平台进一步聚焦复杂体系的蛋白质动态研究前沿技术及其临床应用。2025年，联合实验室首次发布了Systems Health & Disease（SHD）数据库，SHD数据库是基于系统生物学框架构建的大型人群多组学资源平台，旨在突破单一层次和单一人群的数据局限，支持多组学数据挖掘和整合，为创建AI赋能的多模态诊疗支持体系提供数据基础。
业务定位：开展面向全院的大人群深度多组学检测与转化业务。
传统局限：传统“假设驱动”的细胞/动物研究多属于单线条、局部性探索，受限于真实世界的复杂性，其成果在临床诊疗中的适用度与准确度较为有限。
核心路径：打通“从临床人群中来，到临床诊疗中去”的数据驱动（Data-driven）路径。
建设目标：全面汇聚全院各科室样本，通过深度组学技术开发，产出高通量、深度的组学分子数据，构建百万级系统健康与疾病分子数据资产底座。
1、大人群高通量深度蛋白质与代谢组学检测
—高深度蛋白质组学：实现大人群、高通量、高复现性的蛋白质组精确定量及微量蛋白深度筛查。
—广谱与靶向代谢/脂质组学：覆盖脂质、内源性代谢物、营养物质及环境污染物等多种分子。
2、临床数据资产化构建与“队列-转化”全流程服务
—践行数据驱动（Data-driven）研发路径，为各临床科室及前瞻性队列研究提供一站式转化支持。
—协助科室进行规范化临床样本前处理与高质数据产出，助力打造百万级系统健康与疾病分子数据资产。
—临床转化与方案设计：提供从“临床问题提出 - 队列组学设计 - 实验检测 - 算法挖掘 - 临床验证”的全链路协同，推动高水平科研成果转化与临床应用落地。
全部